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藥明明碼袁健中:基因大數(shù)據(jù)賦能平臺,完善罕見病診斷和治療閉環(huán)

作者:編輯 ? 時間:2018-10-24 ? 瀏覽:人次

罕見病領(lǐng)域,藥物研發(fā)難、診斷難,藥明明碼如何專注基因大數(shù)據(jù),并做對了三件大事?

罕見病是人類醫(yī)學(xué)面臨的最大挑戰(zhàn)之一,罕見病之所以“罕見”,是因為其患病率和發(fā)病率極低、患病人數(shù)少、患病人群分散。國際確認(rèn)的罕見病約有7000多種,大概占人類疾病的10%。目前只有1%的罕見病有治療藥品(治療罕見病的藥品稱為“孤兒藥”)。巨大的資源投入和極少數(shù)的病例資源造成了難以想象的困難。

在罕見病的產(chǎn)業(yè)鏈中,研發(fā)救命的孤兒藥在各個環(huán)節(jié)都受到政策及市場的支持,藥企固然是至關(guān)重要的一環(huán)。此外,根據(jù)《中國罕見病研究報告(2018)》的數(shù)據(jù)顯示,在已知的罕見病中,80%為遺傳性疾病,精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)也因此成為預(yù)防罕見病的有效手段。因此,針對罕見病,加速藥物研發(fā),提高罕見病診斷,成為企業(yè)努力的兩大方向。

藥明康德集團企業(yè)藥明明碼(WuXi NextCODE)由藥明康德基因組學(xué)中心和精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)分析的領(lǐng)導(dǎo)者冰島NextCODE Health公司整合成立。為世界各地的研究人員、臨床醫(yī)生、健康機構(gòu)以及個人消費者等提供全面的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)整體解決方案。助力全球合作伙伴加速藥物研發(fā)、診斷試劑開發(fā)、降低人類出生缺陷、提高罕見病診斷和其他精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的臨床應(yīng)用。

在此前第七屆中國罕見病高峰論壇上,動脈網(wǎng)(微信:vcbeat)采訪了藥明明碼高級副總裁及中國區(qū)總經(jīng)理袁健中先生,了解藥明明碼在罕見病領(lǐng)域所貢獻的力量。

藥明明碼高級副總裁及中國區(qū)總經(jīng)理袁健中先生

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罕見疾病診斷率不足40%

在各利益相關(guān)方的共同努力下,各國家和地區(qū)在罕見病領(lǐng)域的研究、診斷、治療及醫(yī)療保障方面雖取得很大進展,但罕見病患者的生存、治療仍然處于艱難的狀態(tài)。

在2018年9月舉辦的第七屆中國罕見病高峰論壇上,長期致力于推動罕見病事業(yè)的上海四葉草罕見病家庭關(guān)愛中心(CORD)創(chuàng)始人、主任黃如方先生提到,中國有超過1600萬罕見病患者,但面對罕見疾病,只有5%的疾病有可治療的藥物,還不一定都是特效藥物。目前通過FDA批準(zhǔn)上市的孤兒藥有621種,而CFDA批準(zhǔn)進入中國的孤兒藥僅282個,且價格昂貴。

“中國罕見疾病患者明確的診斷率不足40%,也就是說超過6成的罕見病的患者到目前為止并沒有被科學(xué)和準(zhǔn)確的診斷出來。這些患者有可能正在用錯誤的方法治療,或者正在艱難的忍受和等待。”

2018第七屆中國罕見病高峰論壇現(xiàn)場,主辦方供圖

就目前的狀況而言,絕大多數(shù)的罕見病發(fā)病機制、診斷方法和治療手段等沒有答案,需要加以研究。隨著精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的發(fā)展,與疾病有關(guān)的基因突變(變異)的分析檢測逐步從科研走向臨床,為疾病的診斷和鑒別提供科學(xué)的依據(jù),從而降低了新生兒的罕見病發(fā)病率,“將疾病扼殺在‘搖籃’中”。

在中國,致力于基因檢測的企業(yè)有近千家,資本方對這個領(lǐng)域也非??粗?,融資不斷。但由于罕見病種類繁雜,不同種疾病的特異性差距較大,因此聚焦于這一領(lǐng)域,尋找有效的解決辦法,仍然十分困難。

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從遺傳學(xué)遏制罕見病

罕見病在診斷上的難點在于,許多疾病并不知道其發(fā)病機制,基因突變的位點跟疾病如何對應(yīng)起來,光靠基因檢測無法判斷,往往要與醫(yī)生對于臨床癥狀的表型的診斷相結(jié)合。在這一過程中,還存在著許多未被發(fā)現(xiàn)的因基因突變而致病的位點。

“已知的突變位點去做篩查,叫做診斷。未知的位點,需要與很多從事科研的研究人員去做研究,尋找基因突變的位點?!痹≈姓f道。由于過半的罕見病人在兒童期發(fā)病,因此,目前在罕見病診療中,診斷更重于治療。換言之,罕見病的診斷就是在偌大的基因組學(xué)數(shù)據(jù)中,明確遺傳性疾病的發(fā)病機制,篩選鑒定疾病診斷的生物標(biāo)記物和藥物靶點,為更精準(zhǔn)的個性化治療方案提供理論基礎(chǔ)和研究數(shù)據(jù)的過程。

藥明明碼所專注的基因大數(shù)據(jù),是對將大規(guī)模人群遺傳學(xué)數(shù)據(jù)庫及高效數(shù)據(jù)分析解讀工具在內(nèi)的一個高度整合并系統(tǒng)化的平臺的統(tǒng)稱。該平臺能夠?qū)崿F(xiàn)對大規(guī)模的高通量測序數(shù)據(jù)進行高效挖掘與解析。在罕見病領(lǐng)域,藥明明碼做了三件事:

一是為罕見病患者準(zhǔn)確判明潛在的遺傳學(xué)病因提供不可或缺的數(shù)據(jù)支持及相關(guān)分析工具,提高罕見病診斷的效率及準(zhǔn)確性,為后續(xù)臨床診療提供更多的時間與支持;

以藥明明碼與復(fù)旦大學(xué)的合作為例,2015 年,藥明明碼與復(fù)旦大學(xué)附屬兒科醫(yī)院合作,聯(lián)合建立兒科遺傳病聯(lián)合實驗室,由復(fù)旦大學(xué)附屬兒科醫(yī)院提供基因檢測及分析平臺。明碼目前每年與復(fù)旦兒科醫(yī)院合作完成超過10,000例的兒科罕見病病例遺傳檢測及解讀。

復(fù)旦大學(xué)附屬兒科醫(yī)院日均門診量已達7-8千人次。通過在測序平臺及遺傳學(xué)數(shù)據(jù)分析解讀方面的合作,醫(yī)院將有望確診更多疑難雜癥,為患兒提供更有針對性的治療。

二是當(dāng)遺傳病患兒的父母考慮下一胎生育時,基于上述大數(shù)據(jù)平臺提供的臨床輔助診斷報告及攜帶者篩查等檢測將為患者家庭的生育前遺傳咨詢提供依據(jù)與指導(dǎo),幫助患兒父母極大減少再次生育患兒的風(fēng)險;

袁健中表示:“通過基因檢測預(yù)防患兒的出生,是目前比較容易實現(xiàn)的商業(yè)機會。目前,藥明明碼已經(jīng)推出了‘福碼’等備孕人群罕見病攜帶者篩查產(chǎn)品,相信這些基因檢測產(chǎn)品將大大減少中國夫婦產(chǎn)下罕見病患兒的風(fēng)險。”

三是基于高度整合的基因大數(shù)據(jù),有志于推動罕見病治療藥物研發(fā)的藥企可以利用這個平臺發(fā)現(xiàn)潛在的新的藥物設(shè)計靶點,從而為新藥或新的治療方法的開發(fā)指明研究方向。

袁健中認(rèn)為:“光診斷沒有治療,對于罕見病來說肯定是不夠的,無法形成一個完整的閉環(huán)方案。”因此,對于在治療罕見病環(huán)節(jié)扮演重要角色的孤兒藥研發(fā)企業(yè)來說,政策對于新藥上市的放松與稅收的減免,也是絕佳的機會。

通過基因大數(shù)據(jù)分析,可以發(fā)現(xiàn)一些罕見病的致病基因突變和相應(yīng)的治療靶向,這將會提高研究針對性藥物的效率,降低研發(fā)成本。

背靠藥明康德,藥明明碼在與藥企的合作上本就有得天獨厚的優(yōu)勢,藥明康德是新藥研發(fā)外包公司,在全球,每年美國FDA每年批準(zhǔn)的新藥中有超過60%的比例是通過藥明康德的幫助研發(fā)上市。

“如果我們借助兄弟公司在藥物研發(fā)方面的力量,加上藥企的合作伙伴,找到新的藥物研發(fā)的靶點和方向,這才是真正解決罕見病的途徑。”

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“中國不缺數(shù)據(jù),而是缺系統(tǒng)化的數(shù)據(jù)”

真實世界的數(shù)據(jù)量越大,對算法的訓(xùn)練就越有益,但首先是對疾病的理解,在醫(yī)療和AI領(lǐng)域,都會有一些通用的模型,如果對疾病本身的理解不夠,數(shù)據(jù)再大,分析再久,也沒意義;其次是數(shù)據(jù),算法如果沒有海量的數(shù)據(jù)去訓(xùn)練,算法本身也沒有用。換句話說,如果算法的差異性沒有大到顛覆性的情況下,數(shù)據(jù)源和數(shù)據(jù)量級就是最大的差異。

相對于喂養(yǎng)人工智能的大數(shù)據(jù),某些特定種類罕見病的病例數(shù)量甚至都無法稱之為“小數(shù)據(jù)”,但是對于一定樣本量的基因組學(xué)數(shù)據(jù)來說,卻是非常大的數(shù)量量級。而對于醫(yī)療機構(gòu)或者藥企而言,要處理大量級的基因數(shù)據(jù)并非易事。

如復(fù)旦兒科,每年的樣本門診量將近200萬人。相對于巨大的門診量,用基因檢測手段進行篩查的新生兒樣本量在1萬人左右,如果由醫(yī)院本身建立數(shù)萬基因組數(shù)據(jù)分析平臺或?qū)嶒炇业脑挘杀鞠喈?dāng)高。為負(fù)擔(dān)成本,相應(yīng)的檢測費用將十分昂貴,這是醫(yī)院的病人所無法承受的。

而明碼搭建的基因大數(shù)據(jù)賦能平臺恰恰是公益與商業(yè)化相結(jié)合,用商業(yè)化運作的公司與醫(yī)院合作的方式,解決彼此不能解決的問題。同理,在進行新藥研發(fā)的藥廠,如果要建立大量級的基因組學(xué)的數(shù)據(jù)分析和挖掘平臺,亦十分困難。因此,藥明明碼打造的是開放式的,面向個體、醫(yī)院、藥企的一體化平臺,降低用戶的生產(chǎn)成本。

數(shù)據(jù)孤島是存在在醫(yī)療健康行業(yè)的一大問題,醫(yī)療機構(gòu)與醫(yī)療機構(gòu)之間,患者與藥企之間,數(shù)據(jù)之間的割裂成為阻礙產(chǎn)業(yè)發(fā)展的主要因素。對此,袁健中表示:“中國不缺數(shù)據(jù),而是缺系統(tǒng)化的數(shù)據(jù)。對于數(shù)據(jù)大家都不愿意去分享,都不愿意去交換。”

2018年7月,藥明明碼發(fā)布了發(fā)布基于區(qū)塊鏈技術(shù)的大健康數(shù)據(jù)銀行——“LifeCODE.ai”,LifeCODE.ai數(shù)據(jù)銀行創(chuàng)新性地應(yīng)用區(qū)塊鏈技術(shù)解決大健康數(shù)據(jù)采集的合法性和有效性,保護用戶隱私并創(chuàng)造數(shù)據(jù)交互價值。

對于罕見病而言,數(shù)據(jù)是極其寶貴的財富,而明碼在罕見病領(lǐng)域的優(yōu)勢正在于此。目前,藥明明碼的合作伙伴既包括艾柏維這類藥企,也包括復(fù)旦兒科、協(xié)和醫(yī)院等在遺傳學(xué)與罕見病方面有深厚學(xué)科基礎(chǔ)和臨床條件的醫(yī)療機構(gòu)。

袁健中表示:“明碼的目的很簡單,是為了跟醫(yī)院等機構(gòu)一起先積累更多的數(shù)據(jù),正因為明碼有得天獨厚的數(shù)據(jù)的存儲和分析平臺,可以通過大規(guī)模集群服務(wù)器,更好地挖掘這些數(shù)據(jù)背后的內(nèi)容。”

罕見病并不罕見,需要有人呼吁,有人站出來倡導(dǎo)。作為罕見病行業(yè)的推動者,袁健中最后向我們表示,明碼愿意成為這一領(lǐng)域的帶頭人,更好地為醫(yī)院、藥企等機構(gòu)賦能,完善從診斷到治療罕見病的閉環(huán)。

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